消費券正式派發，一時間令本地零售市場好像熱鬧起來，不過有關電子支付在使用上的問題及爭議亦受到大家的關注，繼有用戶投訴 Tap & Go 在使用消費券時經常出現無法交易的或扣多錢的情況。日前，有顧客投訴懷疑有商戶向使用八達通消費券購物顧客的收取額外手續費。八達通回應有關查詢後，表示會跟進相關個案，如發現商戶有違規，不排除會取消合作協議。
報道指，有消費者於沙田石門的一間藥房，使用八達通消費券購物，發現藥房收取額外的手續費。雖然涉事藥房後來在社交平台表示，由於成本問題，當時已經客戶表明，如使用八達通購物超過 $200 元將需要收取 2%「銀行手續費」，並強調會在雙方同意下才會完成交易。後來該藥房店更暫停接受八達通付款，只收現金。
網友回應指，其實藥房及部分商戶會針對使用電子支付的交易收取 2-3% 的「銀行手續費」，例如一些售賣相機的樓上舖，使用信用卡或使用包括 WeChat Pay HK 及 AliPay HK 在內的電子支付會收取 1~2 % 的手續費，如果需要分期付款，更可能要 3%，當然在付款前，商戶必須和客戶好好溝通以避免爭拗。
就有關投訴，八達通表示，在開戶協議中有提及商戶應收取實際貨品價格，不應包括手續費之類的額外費用等。如有商戶有違規情況，八達通有權取消該商戶資格。