雖然 AirPods 推出才不過一個月左右，不過因為它並不是入耳式的設計，沒有耳塞或耳棉等東西。所以在經常和使用者親密接觸的情況下，也應該定時給它清潔一下，確保衛生。
由於 AirPods 的外型設計和隨機附送的 EarPods 很接近。所以清潔的方法大致上也差不多。建議使用牙籤，輕輕挑走耳機播音器上的耳垢，但小心不要把播音器刺穿。機殼方面可以用棉花棒及酒精去清潔便可。
至於充電盒方面，因為有機會放入衣袋裏面，可能會令充電盒沾到一些衣物纖維。但由於充電盒本身有電池之類的東西，所以不建議用清潔去清理充電盒的內部。建議可以用「寶貼」之類的萬用貼將裡面的塵埃及衣物纖維黏走。而充電槽，可嘗試將廚房紙巾捲成條狀去清理。
當然有人想過為 AirPods 加上舊耳機的耳棉。不過根據我們試驗過之後，雖然加上耳棉之後，AirPods 在佩帶時候會更穩固，不過就會阻礙了它的感應裝置，令我們摘下耳機的時候，手機也不懂得暫定播放音樂。